明世宗嘉靖二十一年（公元1542年）
袞必哩克墨爾根濟農病逝，其子吉能（諾顏達喇）嗣。
明世宗嘉靖二十五年（公元1546年）
蒙古阿勒坦汗及兀慎娘子，在磚塔城（今呼和浩特市東白塔村西南）用牛2犋，耕地約五六頃，所種皆谷、黍、秫、糜等。后又用逃往蒙古地區(qū)漢人，開發(fā)豐州灘（今土默川）的農業(yè)，建立許多板升，使豐州灘逐步趨于半農半牧化。
明世宗嘉靖二十六年（公元1547年）
蒙古博迪汗死。打來孫繼汗位，稱庫登汗。
明世宗嘉靖二十七年（公元1548年）
打來孫汗迫于來自右翼三萬戶的壓力，率所部東遷至今西拉木倫河河套一帶。
明世宗嘉靖二十九年（公元1550年）
八月 阿勒坦汗統(tǒng)兵大舉南下，以武力迫使明王朝答應通貢。由古北口入邊，經懷柔直抵北京城下，明王朝大震，史稱“庚戌之變”。
明世宗嘉靖三十年（公元1551年）
明王朝先后在大同鎮(zhèn)羌堡、宣府新開口堡以及延、寧開馬市，與右翼土默特、鄂爾多斯和喀喇沁諸部進行互市交易。翌年（公元1552年），明王朝即關閉全部馬市。
明世宗嘉靖三十六年（公元1557年）
蒙古打來孫汗死。
明世宗嘉靖三十七年（公元1558年）
圖們即蒙古大汗位，稱札薩克圖汗。圖們汗在位時，一度任命察哈爾萬戶的阿穆岱鴻臺吉、喀爾喀萬戶的衛(wèi)征索博亥、鄂爾多斯萬戶的徹辰鴻臺吉、土默特萬戶的楚嚕克、永謝布萬戶的諾木達喇古拉齊諾延為五執(zhí)政，協(xié)調各部關系。
明穆宗隆慶四年（公元1570年）
九月 阿勒坦汗孫把漢那吉歸附明王朝，促成了蒙古與明王朝的和平，史稱“俺答封貢”。
明穆宗隆慶五年（公元1571年）
五月 阿勒坦汗至大同得勝堡，受明王朝所封順義王稱號。此后，阿勒坦汗的領地即自稱為“大明金國”。
同年 “俺答封貢”告成后，大同得勝堡馬市立即開張，隨后又陸續(xù)在大同新平堡、守口堡、宣府張家口、山西水泉營、延綏紅山市、寧夏清水營、中衛(wèi)、平虜衛(wèi)、甘肅洪水扁都口、高溝寨等處開馬市。今內蒙古地區(qū)與中原各地的馬市貿易盛況空前。
明穆宗隆慶六年（公元1572年）
庫庫和屯（今呼和浩特市舊城區(qū)）破土興建。
明神宗萬歷三年（公元1575年）
十月 庫庫和屯建成后，明王朝應阿勒坦汗之請，賜庫庫和屯名“歸化”。阿勒坦汗派遣使官，攜帶鞍馬、弓矢等，赴明王朝迎請佛像、經文、蟒緞等物。
明神宗萬歷六年（公元1578年）
阿勒坦汗赴青海仰華寺與達賴三世索南嘉措會面。時蒙古、藏、畏兀兒、漢等族10萬余人參加法會，蒙古族有千人受戒，皈依藏傳佛教。索南嘉措贈阿勒坦汗以“轉干金法輪咱克喇瓦爾第徹辰汗”尊號，阿勒坦汗贈索南嘉措“圣識一切瓦齊爾達賴喇嘛”尊號。阿勒坦汗許愿回歸化城后用寶石金銀裝飾釋迦牟尼佛像，藏傳佛教自此很快傳遍整個蒙古地區(qū)。隨著藏傳佛教的傳入，印度醫(yī)學和藏醫(yī)學也隨之傳入蒙古地區(qū)。
明神宗萬歷七年（公元1579年）
阿勒坦汗命重譯《佛說金光明權柄經皇》。
明神宗萬歷八年（公元1580年）
十二月 阿勒坦汗在歸化城建寺,明王朝命名為“弘慈寺”（今呼和浩特市大召寺,亦稱“銀佛寺”）。
同年 阿勒坦汗病重，其部下欲廢佛殺僧，被阿勒坦汗嚴行禁止。
明神宗萬歷九年（公元1581年）
十二月 阿勒坦汗在黃河濱汗帳內死，時年75歲（時合公元1582年1月）。
明神宗萬歷十年（公元1582年）
春 明王朝特派使節(jié)攜名貴祭品前往吊唁阿勒坦汗。
明神宗萬歷十一年（公元1583年）
閏二月 明王朝準黃臺吉襲封順義王，自號“乞慶哈”（徹辰汗）。
明神宗萬歷十二年（公元1584年）
應阿勒坦汗遺族之請，三世達賴喇嘛啟程赴土默特部。翌年（公元1585年）夏，三世達賴喇嘛至土默特部。
明神宗萬歷十三年（公元1585年）
十二月 順義王黃臺吉（乞慶哈）死。
同年 歸化城延福寺建成（即今呼和浩特市席力圖召）。
明神宗萬歷十四年（公元1586年）
夏 順義王黃臺吉長子扯力克即位。
明神宗萬歷十五年（公元1587年）
三月 三世達賴喇嘛為阿勒坦汗舉行火葬儀式。
△ 明王朝準扯力克襲封順義王，封三娘子為忠順夫人。
同年 喀喇沁的阿尤喜固什創(chuàng)制了記寫梵文、 藏文的特殊字母“阿里嘎里字母”，用以轉寫藏文借詞。這種字母在翻譯佛教經文中起到了重要作用。
明神宗萬歷十六年（公元1588年）
三世達賴喇嘛應喀喇沁部之請，赴喀喇沁部傳教，在章古臺地方圓寂。
明神宗萬歷十七年（公元1589年）
四世達賴喇嘛云丹嘉措誕生于阿勒坦汗孫松木兒臺吉家中。
明神宗萬歷二十年（公元1592年）
蒙古圖們汗死。
明神宗萬歷二十一年（公元1593年）
西藏三大寺院僧官、喇嘛赴土默特歸化城席力圖召，迎接四世達賴喇嘛云丹嘉措。
△ 卜言臺周（布延臺吉）即蒙古大汗位，稱徹辰汗。
△ 扯力克汗、三娘子討請喇嘛傳習經典，明王朝遣占班麻等4僧前往。此后，由席力圖古希、巧爾齊等高僧將《波羅密心經》譯成蒙文。繼之，108部《甘珠爾經》也被譯成蒙文。
△ 努爾哈赤率女真兵大敗葉赫、哈達、烏拉、輝發(fā)、長白山朱舍里、長白山訥殷、蒙古科爾沁、錫伯、卦爾察等九部聯(lián)軍于古勒山下，史稱“癸巳之戰(zhàn)”。自此，開始了滿洲與蒙古政治意義上的交往關系。
明神宗萬歷三十年（公元1602年）
八月 扯力克汗、三娘子派專使率兵護送四世達賴喇嘛云丹嘉措入藏。
明神宗萬歷三十一年（公元1603年）
蒙古卜言臺周（徹辰汗）死。
明神宗萬歷三十二年（公元1604年）
林丹即蒙古大汗位，時年13歲，稱庫圖克圖汗。
△ 邁達哩呼圖克圖至土默特坐床，掌蒙古佛教。
明神宗萬歷三十五年（公元1607年）
四月 順義王扯力克汗死。
同年 《阿勒坦汗傳》成書。
明神宗萬歷四十年（公元1612年）
正月初一日 努爾哈赤娶蒙古科爾沁貝勒明安之女為妻。自此，奠定了清代以滿蒙政治聯(lián)盟為基礎的姻戚關系。
六月 忠順夫人三娘子死。
十月 明王朝準卜石兔襲封順義王，并封把漢比吉為忠順夫人。
明神宗萬歷四十二年（公元1614年）
六月 皇太極娶蒙古科爾沁貝勒莽古思之女博爾濟錦氏為妻，后被清王朝尊為孝端文皇后。
明神宗萬歷四十四年后金太祖天命元年（公元1616年）
正月 努爾哈赤稱汗，建元天命，國號金，史稱后金。
七月十九日 后金汗（清太祖）努爾哈赤派兵征討今黑龍江、精奇里江地區(qū)索倫各部（明代末期，居住在黑龍江流域一帶的鄂溫克，鄂倫春、達斡爾等民族，被泛稱為“索倫”人）。
明神宗萬歷四十七年后金太祖天命四年（公元1619年）
十一月十二日 后金與蒙古內喀爾喀五部27貝勒在岡干塞忒勒黑盟誓。自此，滿蒙關系由聯(lián)姻階段開始進入聯(lián)盟階段。
明熹宗天啟二年后金太祖天命七年（公元1622年）
三月 后金在八旗滿洲內設立蒙古旗。
明熹宗天啟四年后金太祖天命九年（公元1624年）
二月 蒙古科爾沁部酋長奧巴與后金會盟。
五月 蒙古科爾沁部桑阿爾寨臺吉以女適后金貝勒多爾袞。
明熹宗天啟五年后金太祖天命十年（公元1625年）
二月 蒙古科爾沁部酋長齋桑以女適后金皇太極，皇太極將其女封為莊妃。此即清代著名的孝莊文皇后。
九月 蒙古林丹汗攻科爾沁奧巴部，后金出兵幫助奧巴解圍。十一月，林丹汗不戰(zhàn)而退，蒙古諸部與后金紛紛結盟。自此，林丹汗失去了蒙古“共主”的地位。
明熹宗天啟六年后金太祖天命十一年（公元1626年）
六月初一日 努爾哈赤與科爾沁臺吉奧巴祭天盟誓，結為同盟，并封奧巴為土謝圖汗。自此，科爾沁蒙古以婚姻為紐帶，終于同滿洲結成了鞏固的政治同盟。
明熹宗天啟七年后金太宗天聰元年（公元1627年）
二月 林丹汗攻討扎魯特和巴林，促使兩部投科爾沁。
七月 蒙古敖漢，奈曼部投附后金。
十一月 察哈爾部的昂坤投附后金。
十二月 黑龍江人（包括索倫人）首領向后金皇太極貢貂皮等方物。
明思宗崇禎元年后金太宗天聰二年（公元1628年）
林丹汗西進河套，征服土默特等部，占據(jù)歸化城（今呼和浩特市），鄂爾多斯等部相繼服屬林丹汗。
△ 后金與內喀爾喀會盟，皇太極統(tǒng)軍征察哈爾部，大掠而還。
明思宗崇禎二年后金太宗天聰三年（公元1629年）
正月 皇太極命科爾沁、敖漢、奈曼、喀喇沁、內喀爾喀五部悉遵后金制度，將滿洲八旗軍政合一、兵民合一的組織形式推行到蒙古各部。
七月 喀喇沁、土默特等部遣使至后金。
九月 皇太極第一次以“盟主”的身份召集科爾沁、喀喇沁、敖漢、奈曼及內喀爾喀五部諸貝勒，征伐林丹汗。
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