民國36年（1947）5月1日，內蒙古自治政府在興安盟王爺廟街（今烏蘭浩特市）正式成立。民國38年（1949）9月19日，西部區綏遠省和平解放。1949年12月31日，綏遠省人民政府成立。1950年1月，在中共綏遠省委民族工作委員會領導下，成立了綏遠省民族事務委員會，分管民族工作和喇嘛教、伊斯蘭教工作。1954年3月6日，綏遠省和內蒙古自治區正式合并，撤銷綏遠省建制和綏遠省人民政府，原綏遠省轄區統一由內蒙古自治區人民政府領導。1954年3月6日，中共內蒙古自治區委員會和政府成立了內蒙古自治區民族事務委員會，內設民族宗教處分管喇嘛教和伊斯蘭教工作，內蒙古自治區文教委員會宗教處分管天主教和基督教工作。

1955年11月21日，在內蒙古自治區文教委員會宗教處的基礎上，成立了內蒙古自治區政府宗教事務處。1956年6月14日，內蒙古自治區政府宗教事務處改為內蒙古自治區宗教事務管理局，同時將內蒙古自治區民族事務委員會的二處（民族宗教處）歸宗教事務管理局。

1958年3月6日，內蒙古自治區民族事務委員會與內蒙古自治區政府宗教事務管理局合并，成立了內蒙古自治區民族宗教事務委員會。

1964年12月13日，內蒙古自治區民族事務委員會一套機構兩個牌子，對外掛“內蒙古自治區民族事務委員會”和“內蒙古自治區宗教局”兩塊牌子。

“文化大革命”期間，黨的宗教信仰自由政策受到嚴重破壞。1968年9月13日，內蒙古自治區民族事務委員會、宗教局的機構被撤銷，人員被編入內蒙古自治區毛澤東思想大學校一分校三連（統戰口）。

1976年初，內蒙古自治區黨委決定恢復民族宗教工作機構，成立了內蒙古自治區革命委員會民族事務局。

1978年5月，正式恢復了內蒙古自治區民族事務委員會，專管民族和宗教工作。

1983年6月，內蒙古自治區政府宗教事務局正式恢復，同內蒙古自治區民族事務委員會合署辦公，一套機構兩塊牌子。

1994年5月5日，內蒙古自治區黨委以內黨發〔1994〕8號文件決定，內蒙古民族事務委員會與內蒙古自治區宗教局一個機構兩塊牌子，同時掛蒙古語文工作委員會和八省區蒙古語文協作領導小組辦公室牌子。2000年機構改革中，保持了此機構設置。

1957—2008年內蒙古自治區宗教事務部門領導人員任職表

表8—1