元至順元年(1330),今杭錦旗境基本上屬甘肅行省兀剌海路轄地;南部屬陜西行省延安路。明朝初年屬東勝衛,天順年間蒙古族入駐。明正德五年(1510),統屬蒙古鄂爾多斯萬戶。清順治六年(1649),編為鄂爾多斯右翼后旗,俗稱杭錦旗(轄境相當于今杭錦旗北部、臨河市大部、五原縣和杭錦后旗各一部分地區)。下設9參領區、42佐領。設札薩克世襲掌理旗務,駐鄂爾吉虎諾爾。
清乾隆五年(1740),鄂爾多斯右翼后旗(杭錦旗)與阿拉善旗之間發生邊境糾紛,清廷派員裁決,兩旗以黃河為界,河西為阿拉善旗牧地,河東為鄂爾多斯右翼后旗牧地。清末,貽谷督辦墾務大臣廣放蒙地后,旗屬黃河北岸牧地,大部成為墾區,屬烏伊盟墾務局。清光緒二十九年(1903),設置五原廳,統領黃河北岸河套地區的行政事務。
元至順元年(1330),今杭錦旗境基本上屬甘肅行省兀剌海路轄地;南部屬陜西行省延安路。明朝初年屬東勝衛,天順年間蒙古族入駐。明正德五年(1510),統屬蒙古鄂爾多斯萬戶。清順治六年(1649),編為鄂爾多斯右翼后旗,俗稱杭錦旗(轄境相當于今杭錦旗北部、臨河市大部、五原縣和杭錦后旗各一部分地區)。下設9參領區、42佐領。設札薩克世襲掌理旗務,駐鄂爾吉虎諾爾。
清乾隆五年(1740),鄂爾多斯右翼后旗(杭錦旗)與阿拉善旗之間發生邊境糾紛,清廷派員裁決,兩旗以黃河為界,河西為阿拉善旗牧地,河東為鄂爾多斯右翼后旗牧地。清末,貽谷督辦墾務大臣廣放蒙地后,旗屬黃河北岸牧地,大部成為墾區,屬烏伊盟墾務局。清光緒二十九年(1903),設置五原廳,統領黃河北岸河套地區的行政事務。